پس از درگذشت آیت الله محمدتقی بهجت و خاکسپاری ایشان در حرم حضرت معصومه (س) تا دو ماه نام و نشان ثابتی بر روی مزار ایشان نبود و پس از آن نیز صندوق چوبی با پارچه ای سیاه روی قبر این عالم دینی قرار داشت.